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El programa de Microbiología de la Universidad Popular del Cesar, es un programa de formación Universitaria en pregrado, presencial y de modalidad diurna que tiene una duración de 10 semestres académicos y fue creado mediante el Acuerdo Superior 007 de 1999 de la Universidad Popular del Cesar, recibiendo código ICFES No. 112045745762000111100 como programa de pregrado adscrito a la Facultad Ciencias de la Salud. Inició actividades académicas el segundo semestre de 2000 y en el marco de su visión, misión y el desarrollo del plan de estudios, se propuso formar profesionales competentes que dieran respuesta a las necesidades y problemáticas del Departamento del Cesar, cuya economía se fundamenta principalmente, en la producción agrícola, minera y ganadera donde se puede desarrollar la Microbiología como ciencia.