En Colombia la institucionalización de la investigación sigue un desarrollo lento debido a las dificultades en la centralización de los instrumentos del Estado.

En 1898 se crea el Parque de Vacunación, y en 1900 se presenta un proyecto para establecer un laboratorio bacteriológico, que no logra concretarse.

En 1914 se crea el Instituto Bacteriológico Central, que tampoco logra desarrollarse y en 1919 se funda un Laboratorio Oficial de Higiene al servicio de la Dirección Nacional de Higiene, que se había establecido en 1918.

En 1917 se funda un laboratorio particular por Martínez Santamaría y Bernardo Samper que en pocos años adquiere gran prestigio y sirve al Estado mediante contratos.

En 1923 llega la Comisión de la Fundación Rockefeller para estudiar la fiebre amarilla, las investigaciones para confirmar el diagnóstico se hicieron en ese laboratorio. Según uno de los miembros de la Comisión, este laboratorio «es de los mejores de la Historia de instituciones de investigación”

En 1925 el gobierno compra el Laboratorio de Samper y Martínez y lo reorganiza con la ayuda de la Fundación Rockefeller.

En 1926 se crea una junta especial para formular un plan destinado a organizar el Instituto Nacional de Higiene integrando el Laboratorio de Higiene, el Parque de Vacunación y el Laboratorio Bacteriológico, y en 1928 se promulga la ley que organiza el Instituto Nacional de Higiene Samper Martínez. Desde entonces la investigación adquiere un gran desarrollo, coincidiendo con un aumento notable de la exportación cafetalera.

Las investigaciones sobre la lepra también sufren altibajos. En 1907, cuando el estado se hace cargo de los lazaretos para el aislamiento obligatorio de los enfermos, se crea un Laboratorio Central y en 1932 se designa a Lleras Acosta, un investigador de lepra, como director del Laboratorio Central de Investigaciones.

Para el año de 1998, tuvo lugar la primera clase o sesión académica de la Especialización en Epidemiología de la Fundación Universitaria Juan N. Corpas (FUJNC) en la universidad popular del Cesar, que luego para el año 2000 inicia su propia especialización. Durante este cuarto de siglo de historia, médicos, enfermeros, estadísticos, psicólogos y otros profesionales de las más diversas profesiones, han cursado este programa y han alcanzado los más altos estándares de calidad necesarios para convertirse en Epidemiólogos al servicio de su región y del país, con compromiso social y mirada global. Gracias a la creación de este programa, la Universidad popular del Cesar fue parte fundamental en el avance de la formación de epidemiólogos en recurso humano de alta demanda desde los años noventa por los entes locales y departamentales de la región.

La Universidad Popular del Cesar, con su extraordinaria formación profesional y visión sobre el futuro de esta especialidad, asumieron el liderazgo necesario y vieron la importancia de formar epidemiólogos profesionales con énfasis primordial en la investigación de campo, comprendiendo los desafíos que tenían las instituciones de salud y el gobierno nacional al enfrentarse a enfermedades, epidemias y problemas de salud pública que afectaban a miles de colombianos en todas las regiones del país.

Hacia la primera mitad de la década de los 90´s, Colombia estaba viviendo unas transformaciones de vital importancia. Acababa de crearse la nueva Constitución Política del 1991, se promulgó la Ley 100 en el 93, y se implementaron reformas a la educación largamente esperadas, a partir de la Ley 30 de 1992, por la cual se organiza el servicio de la Educación Superior.

En ese contexto, en la Universidad Popular del Cesar se llegó a la conclusión de que para que un nuevo sistema de salud funcionara, era necesario avanzar en la formación en salud en cuatro áreas: Modelo Familiar en Salud, Análisis Epidemiológicos, Gestión de Recursos en Salud (recurso humano y financiero) y Sistemas de Calidad en la prestación de Servicios.

Para el segundo semestre del año 2000 se inicia como especialización propia de la UPC, mediante Acuerdo CSU. 011 de 19 de marzo de 1998 (Anexo 2), para el año 2002 se da el egreso de la primera promoción de Epidemiólogos del programa propio de la U.P.C. Se encuentra como programa con registro calificado vigente de Resolución 01484 del 6 de febrero del 2015 (Anexo 3).

En el año 2009 se obtiene del primer registro calificado por 5 años, según resolución 2501 de 06 de mayo del 2009; en el año 2012 se realiza el segundo proceso de Autoevaluación del programa de especialización en Epidemiologia y para el año 2015 se Obtiene del registro calificado por 7 años, según resolución 01484 del 8 de febrero del 2015; en el año 2018 se realiza otro proceso de autoevaluación con miras a obtener nuevamente el registro calificado por cumplimiento del tiempo en el año 2021.

La propuesta del nuevo plan de estudios fue aprobada por el Acuerdo número 083 del 01 de diciembre del 2020 por el Consejo de académico de la Universidad Popular del Cesar (Anexo 4); la estructura curricular propuesta, cuenta con 36 créditos académicos y tres semestres, para otorgar el título de especialista en Epidemiologia

La propuesta del nuevo plan de estudios fue aprobada por el Acuerdo número 083 del 01 de diciembre del 2020 por el Consejo de académico de la Universidad Popular del Cesar (Anexo 4); la estructura curricular propuesta, cuenta con 36 créditos académicos y tres semestres, para otorgar el título de especialista en Epidemiologia.

En cuanto a reformas curriculares, la especialización de epidemiologia ha realizado a lo largo de su historia, tres (3) actualizaciones académicas:

La primera se realizó en el año 2009 para implementar reformas en los contenidos académicos de unas asignaturas, la segunda se realizó en el año 2012 con el ánimo de darle mayor flexibilidad al currículo y la última desarrollada para el año 2018, el cual se da para modificar el perfil de egreso de la especialización a un epidemiólogo de campo.